Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCAP28676 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCAP28676 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms