Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTX3P26022 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTX3P26022 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTX3P26022 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms