Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms