Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCP25054 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCP25054 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCP25054 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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