Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A1P23297 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A1P23297 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A1P23297 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A1P23297 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms