Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRHP20396 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRHP20396 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRHP20396 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRHP20396 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRHP20396 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRHP20396 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRHP20396 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRHP20396 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRHP20396 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRHP20396 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRHP20396 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRHP20396 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
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