Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RCC1P18754 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms