Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF4P18085 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF4P18085 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF4P18085 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF4P18085 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF4P18085 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF4P18085 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF4P18085 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF4P18085 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF4P18085 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms