Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA6P17658 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms