Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms