Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX6A1P12074 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms