Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms