Protein–RNA interactions for Protein: P10124

SRGN, Serglycin, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGNP10124 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGNP10124 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGNP10124 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGNP10124 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms