Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms