Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP10P09238 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP10P09238 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP10P09238 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP10P09238 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms