Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MSMBP08118 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSMBP08118 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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MSMBP08118 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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MSMBP08118 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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MSMBP08118 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSMBP08118 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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MSMBP08118 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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MSMBP08118 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSMBP08118 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSMBP08118 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSMBP08118 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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