Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC1P02654 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC1P02654 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms