Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSD2O96028 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSD2O96028 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD2O96028 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms