Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NUDT3O95989 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms