Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNTO95613 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNTO95613 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNTO95613 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNTO95613 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNTO95613 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNTO95613 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms