Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms