Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPLNO95428 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPLNO95428 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms