Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms