Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC22O60826 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms