Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms