Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPLO60437 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPLO60437 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPLO60437 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPLO60437 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPLO60437 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPLO60437 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPLO60437 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPLO60437 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPLO60437 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPLO60437 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms