Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALUO43852 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALUO43852 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALUO43852 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALUO43852 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALUO43852 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALUO43852 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALUO43852 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALUO43852 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms