Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DENRO43583 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DENRO43583 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DENRO43583 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DENRO43583 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms