Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1GO43497 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1GO43497 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms