Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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