Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTIFO43310 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTIFO43310 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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