Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCAO15360 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCAO15360 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCAO15360 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms