Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms