Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APAF1O14727 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms