Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms