Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms