Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1D1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1D1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1D1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1D1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1D1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms