Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms