Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms