Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A8MVJ9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 576.3 ms