Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms