Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA6A0AVT1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA6A0AVT1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms