Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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