Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPACA6W5XKT8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms