Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms