Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms