Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms