Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms