Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms