Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms